MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 60791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015183	TGC	2	6	120567	120572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2502	NC_015183	CGC	2	6	120573	120578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291558
2503	NC_015183	GCC	2	6	120655	120660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291558
2504	NC_015183	CG	3	6	120681	120686	0 %	0 %	50 %	50 %	325291558
2505	NC_015183	CAG	2	6	120721	120726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2506	NC_015183	ATC	2	6	120727	120732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291558
2507	NC_015183	CGG	2	6	120744	120749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291558
2508	NC_015183	TGG	2	6	120753	120758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291558
2509	NC_015183	GGC	2	6	120780	120785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291558
2510	NC_015183	CTG	2	6	120811	120816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2511	NC_015183	CGA	2	6	120833	120838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2512	NC_015183	TGC	2	6	121023	121028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2513	NC_015183	TGT	2	6	121046	121051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291558
2514	NC_015183	GACC	2	8	121113	121120	25 %	0 %	25 %	50 %	325291558
2515	NC_015183	CGG	2	6	121125	121130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291558
2516	NC_015183	ACC	2	6	121165	121170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291558
2517	NC_015183	TGC	2	6	121232	121237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291558
2518	NC_015183	GGC	2	6	121383	121388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291558
2519	NC_015183	CAC	2	6	121407	121412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291558
2520	NC_015183	CGG	2	6	121538	121543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_015183	GCC	2	6	121550	121555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2522	NC_015183	CTT	2	6	121558	121563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_015183	CG	3	6	121577	121582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_015183	GT	3	6	121588	121593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_015183	GGCC	2	8	121594	121601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2526	NC_015183	T	6	6	121687	121692	0 %	100 %	0 %	0 %	325291559
2527	NC_015183	ATTC	2	8	121798	121805	25 %	50 %	0 %	25 %	325291559
2528	NC_015183	T	7	7	121857	121863	0 %	100 %	0 %	0 %	325291559
2529	NC_015183	T	7	7	121926	121932	0 %	100 %	0 %	0 %	325291559
2530	NC_015183	ATT	2	6	121988	121993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291559
2531	NC_015183	CCG	2	6	121995	122000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291559
2532	NC_015183	TGC	2	6	122172	122177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2533	NC_015183	TGC	2	6	122196	122201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2534	NC_015183	GCAACC	2	12	122213	122224	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325291560
2535	NC_015183	TCA	2	6	122274	122279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2536	NC_015183	GC	3	6	122301	122306	0 %	0 %	50 %	50 %	325291560
2537	NC_015183	GGC	2	6	122312	122317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291560
2538	NC_015183	CCA	2	6	122319	122324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291560
2539	NC_015183	TCA	2	6	122334	122339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2540	NC_015183	CCG	2	6	122361	122366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291560
2541	NC_015183	GC	3	6	122393	122398	0 %	0 %	50 %	50 %	325291560
2542	NC_015183	GCC	2	6	122429	122434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291560
2543	NC_015183	CGGCG	2	10	122518	122527	0 %	0 %	60 %	40 %	325291560
2544	NC_015183	GTC	2	6	122546	122551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2545	NC_015183	CATC	2	8	122562	122569	25 %	25 %	0 %	50 %	325291560
2546	NC_015183	CTG	2	6	122621	122626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2547	NC_015183	GCG	2	6	122655	122660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291560
2548	NC_015183	CGC	2	6	122661	122666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291560
2549	NC_015183	GCGGTG	2	12	122714	122725	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325291560
2550	NC_015183	CAG	2	6	122800	122805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2551	NC_015183	GAAG	2	8	122818	122825	50 %	0 %	50 %	0 %	325291560
2552	NC_015183	TGC	2	6	122850	122855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2553	NC_015183	CGG	3	9	122893	122901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291560
2554	NC_015183	GAG	2	6	122960	122965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291560
2555	NC_015183	AAT	2	6	123011	123016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291560
2556	NC_015183	TGA	2	6	123084	123089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291560
2557	NC_015183	GAT	2	6	123097	123102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291560
2558	NC_015183	AGC	2	6	123141	123146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2559	NC_015183	CAT	2	6	123163	123168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2560	NC_015183	GCT	2	6	123238	123243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2561	NC_015183	TTA	2	6	123253	123258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291560
2562	NC_015183	CAT	3	9	123271	123279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2563	NC_015183	CTT	2	6	123343	123348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291560
2564	NC_015183	GCTGC	2	10	123376	123385	0 %	20 %	40 %	40 %	325291560
2565	NC_015183	GCT	3	9	123397	123405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2566	NC_015183	GCT	2	6	123424	123429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2567	NC_015183	GGA	2	6	123430	123435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291560
2568	NC_015183	CGA	2	6	123474	123479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2569	NC_015183	CCGA	2	8	123490	123497	25 %	0 %	25 %	50 %	325291560
2570	NC_015183	CTG	2	6	123509	123514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2571	NC_015183	ATC	2	6	123536	123541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2572	NC_015183	GAA	2	6	123559	123564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291560
2573	NC_015183	AGA	3	9	123586	123594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291560
2574	NC_015183	AAGG	2	8	123725	123732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_015183	AG	3	6	123740	123745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_015183	GGT	2	6	123856	123861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291561
2577	NC_015183	GAG	2	6	123914	123919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291561
2578	NC_015183	GCC	2	6	123949	123954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291561
2579	NC_015183	ATT	2	6	123957	123962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291561
2580	NC_015183	GAG	2	6	123980	123985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291562
2581	NC_015183	GCC	2	6	124002	124007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291562
2582	NC_015183	GCAG	2	8	124028	124035	25 %	0 %	50 %	25 %	325291562
2583	NC_015183	CGC	2	6	124061	124066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291562
2584	NC_015183	CGA	2	6	124070	124075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291562
2585	NC_015183	TGGC	2	8	124133	124140	0 %	25 %	50 %	25 %	325291562
2586	NC_015183	AGC	2	6	124155	124160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291562
2587	NC_015183	CTG	2	6	124176	124181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291562
2588	NC_015183	CCA	2	6	124400	124405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291562
2589	NC_015183	TCG	2	6	124426	124431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291562
2590	NC_015183	CG	3	6	124430	124435	0 %	0 %	50 %	50 %	325291562
2591	NC_015183	TGC	2	6	124468	124473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291562
2592	NC_015183	ACG	2	6	124479	124484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291562
2593	NC_015183	GGA	2	6	124487	124492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291562
2594	NC_015183	GCGG	2	8	124509	124516	0 %	0 %	75 %	25 %	325291562
2595	NC_015183	CGC	2	6	124543	124548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_015183	CGG	2	6	124562	124567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_015183	T	7	7	124571	124577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_015183	GAA	2	6	124606	124611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291563
2599	NC_015183	AAG	2	6	124628	124633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291563
2600	NC_015183	ATT	2	6	124648	124653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291563
2601	NC_015183	GATCTG	2	12	124726	124737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325291563
2602	NC_015183	GCA	2	6	124767	124772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291563
2603	NC_015183	CTGG	2	8	124809	124816	0 %	25 %	50 %	25 %	325291563
2604	NC_015183	CGT	2	6	124858	124863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291563
2605	NC_015183	GCC	2	6	124876	124881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2606	NC_015183	CGT	2	6	124891	124896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291563
2607	NC_015183	GAA	2	6	124942	124947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291563
2608	NC_015183	GCC	2	6	124993	124998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2609	NC_015183	CTTCGC	2	12	125010	125021	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325291563
2610	NC_015183	TGC	2	6	125115	125120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291563
2611	NC_015183	GAA	2	6	125179	125184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291563
2612	NC_015183	GC	3	6	125195	125200	0 %	0 %	50 %	50 %	325291563
2613	NC_015183	CCGGAA	2	12	125258	125269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291563
2614	NC_015183	CTT	2	6	125328	125333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291563
2615	NC_015183	TGT	2	6	125349	125354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291563
2616	NC_015183	CCG	2	6	125381	125386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2617	NC_015183	GCG	2	6	125392	125397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291563
2618	NC_015183	CCG	2	6	125405	125410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2619	NC_015183	CAT	2	6	125413	125418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291563
2620	NC_015183	GCC	2	6	125452	125457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2621	NC_015183	CCG	3	9	125468	125476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2622	NC_015183	ACC	2	6	125482	125487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291563
2623	NC_015183	GCC	2	6	125488	125493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
2624	NC_015183	GCC	2	6	125497	125502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291563
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2688	NC_015183	AT	3	6	128150	128155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2689	NC_015183	T	6	6	128193	128198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2690	NC_015183	AT	3	6	128265	128270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2722	NC_015183	A	7	7	129432	129438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2723	NC_015183	GGA	2	6	129538	129543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2745	NC_015183	CCG	3	9	130484	130492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291568
2746	NC_015183	CAT	2	6	130512	130517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291568
2747	NC_015183	ATGAT	2	10	130569	130578	40 %	40 %	20 %	0 %	325291568
2748	NC_015183	A	6	6	130689	130694	100 %	0 %	0 %	0 %	325291569
2749	NC_015183	CAT	2	6	130757	130762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291569
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2751	NC_015183	TGG	2	6	130924	130929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291569
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2753	NC_015183	AGGGC	2	10	130990	130999	20 %	0 %	60 %	20 %	325291569
2754	NC_015183	GC	3	6	131004	131009	0 %	0 %	50 %	50 %	325291569
2755	NC_015183	GAC	2	6	131031	131036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291569
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2767	NC_015183	CCGC	2	8	131825	131832	0 %	0 %	25 %	75 %	325291569
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2770	NC_015183	TCG	3	9	131884	131892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291569
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2773	NC_015183	CAT	2	6	131984	131989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291569
2774	NC_015183	A	6	6	132100	132105	100 %	0 %	0 %	0 %	325291569
2775	NC_015183	CGG	2	6	132106	132111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291569
2776	NC_015183	GAA	2	6	132117	132122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291569
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2852	NC_015183	GCTGA	2	10	135364	135373	20 %	20 %	40 %	20 %	325291573
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2858	NC_015183	TGC	2	6	135554	135559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
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2863	NC_015183	GGC	2	6	135734	135739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291574
2864	NC_015183	CGA	2	6	135755	135760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291574
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2986	NC_015183	TGC	2	6	141949	141954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291580
2987	NC_015183	CGCGT	2	10	141963	141972	0 %	20 %	40 %	40 %	325291580
2988	NC_015183	TGC	2	6	142034	142039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2989	NC_015183	CGA	2	6	142099	142104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2990	NC_015183	CCG	2	6	142153	142158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2991	NC_015183	GCT	2	6	142185	142190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2992	NC_015183	CAT	2	6	142226	142231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291581
2993	NC_015183	TGT	2	6	142243	142248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291581
2994	NC_015183	CAG	2	6	142280	142285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2995	NC_015183	CAC	2	6	142286	142291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291581
2996	NC_015183	GCC	2	6	142322	142327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291581
2997	NC_015183	CAG	2	6	142409	142414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2998	NC_015183	CCAG	2	8	142444	142451	25 %	0 %	25 %	50 %	325291581
2999	NC_015183	TGGC	2	8	142515	142522	0 %	25 %	50 %	25 %	325291581
3000	NC_015183	CAT	2	6	142525	142530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291581

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